百多邦對其它抗生素無交叉耐藥性。與皮膚科病人其它常用的抗生素相比，百多邦保持對敏感菌株的敏感性。但在長期應用百多邦的病例中，亦已分離到對百多邦輕度耐藥的菌株。那么，百多邦軟膏的副作用如何?
　　局部應用百多邦（莫匹羅星軟膏）一般無不良反應，偶見局部燒灼感，蜇刺感及瘙癢等，一般不需停藥。偶見對莫匹羅星或其軟膏質產生皮膚過敏反應。但非常罕見。同時，對莫匹羅星及聚乙二醇基質過敏者禁用百多邦。
　　另外，百多邦（莫匹羅星軟膏）皮膚外用經皮穿透和吸收極少。在一項健康人試驗中，用百多邦2%制劑一次性封包占體表面積70%～80%的皮膚(約合藥3g)8小時或在鼻腔內涂布百多邦，均未測出系統吸收量。在銀屑病或濕疹皮損中外用百多邦，尿中主要代謝產物相當用藥量的0.4%～0.6%，而健康皮膚估計在0.2%～0.3%以下。
　　莫匹羅星透皮吸收極微，即使進入循環，通過副鏈與核之間的醋鍵的去酯化作用轉變為單孢菌酸的形式而失活并迅速從腎臟排泄，因而莫匹羅星只適于局部外用。
莫匹羅星軟膏的作用：
　　一、莫匹羅星軟膏成分中的莫匹羅星是氨酰-tRNA合成酶(AaRS)的抑制劑，而且是.上市的細菌AaRS抑制劑。它可選擇性地使細菌異亮氨酰-tRNA合成酶(AaRS)失活。這些酶通過催化氨酰tRNA(aa-rRNA)的合成對蛋白質生物合成起至關重要的作用。一旦這些酶受到抑制，蛋白質的生物合成就被迫終止，必然導致細菌生長變慢。從而莫匹羅星軟膏可以治療革蘭陽性球菌引起的皮膚感染疾病。
　　二、莫匹羅星軟膏為局部外用抗生素，而抗生素可以干擾蛋白質的合成意味著細胞存活所必需的酶不能被合成。干擾蛋白質合成的抗生素包括福霉素(放線菌素)類、氨基糖苷類、四環素類和氯霉素;還可以抑制核酸的轉錄和復制抑制核酸的功能阻止了細胞分裂和或所需酶的合成。以這種方式作用的抗生素包括萘啶酸和二氯基吖啶。
　　莫匹羅星軟膏的注意事項
　　1.如使用一療程后癥狀無好轉或加重，應立即去醫院就醫。
　　2.感染面積較大者，去醫院就醫。
　　3.百多邦莫匹羅星軟膏僅供皮膚給藥，請勿用于眼、鼻、口等黏膜部位。
　　4.誤入眼內時用水沖洗即可。
　　5.有中度或重度腎損害者慎用。
　　6.孕婦慎用；哺乳期婦女涂藥時應防止藥物進入嬰兒眼內。
　　7.對百多邦莫匹羅星軟膏過敏者禁用，過敏體質者慎用。
　　8.百多邦莫匹羅星軟膏性狀發生改變時禁止使用。
　　9.請將百多邦莫匹羅星軟膏放在兒童不能接觸的地方。
　　10.兒童必須在成人監護下使用。
　　11.如正在使用其他藥品，使用百多邦莫匹羅星軟膏前請咨詢醫師或藥師。